商品用海藻酸钠的分子量通常象多糖海藻酸钠分子式一样，比较分散。因此，一种海藻酸钠的分子量通常代表该组所有分子的平均值。最常见的表达分子量的方式是数均分子量(Mn)和重均分子量(Mw)。

　　在多分散性分子群中，通常Mw>Mn。Mw/Mn的系数为分散性指数，海藻酸钠商品的指数经典范围为1.5~2.5。常用的决定分子量的方法为建立在内在粘性和光散射测定基础上计算而出的。